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Wenn man Interskallenkorrelationen berechnet, dann macht man auch genau das: man berechnet die Korrelation der Skalen.
Wenn man die Korrelation der Faktoren berechnen möchte, dann berechnet man eben die Korrelation der Faktoren.

Du müsstest Dich also entscheiden, was Du berechnen möchtest. Dann ist es auch klar, wie man es berechnet.