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[kablau90]

Hallo,

ich habe eine Frage zu meiner Daten-Auswertung: Ich untersuche Genexpressions-Unterschiede von mehreren Gruppen (2 Kontrollen und 4 Behandlungsgruppen an drei verschiedenen Tagen). In meinem Versuchsaufbau befinden sich n Gene, die betrachtet wurden. Laut dem Wikiedia-Artikel zur Bonferroni-Korrektur müsste ich das Signifikanz-Niveau entsprechend von 0,05 auf 0,05/n setzen. Ich habe jetzt eine ANOVA durchgeführt und zudem als Post hoc-Test Bonferroni angegeben. Muss ich dann noch das Signifikanz-Niveau anpassen oder wird dies automatisch von SPSS durchgeführt? Müsste ich eine Alpha-Korrektur ebenfalls durchführen, wenn ich nur zwei Gruppen testen würde (zB Kontrolle gegen Behandlung)?

Grüße
arne90

[strukturmarionette]

Hi,

ANOVA mit Post hoc Test..
In meinem Versuchsaufbau befinden sich n Gene, die betrachtet wurden.

- Sind die denn intervallskaliert?
- N?
- n..?

Gruß
S.

[kablau90]

Also die von mir gemessenen Expressionen der Gene sind metrisch skaliert. Die Anzahl an Genen variiert zwischen verschiedenen Versuchen. In einem Versuch sind es 60 Gene, in einem zweiten 30 und in einem anderen 11. Ich habe für die Berechnung der Mittelwerte immer drei Replikate.

[strukturmarionette]

Hi,

- das Design und UVs-AVs Konstellationen bleiben (zumindest für mich) unklar.

Gruß
S.

[kablau90]

Hallo,

also für mich sind die verschiedenen Behandlungsgruppen die unabhängigen Variablen (2 unbehandelte Gruppen [Kontrollen] und bis zu 4 Pestizidgruppen) und die abhängige Variable ist die Änderung der Genexpression, die ich messe. Im Endeffekt beschreibt das Beispiel im Wiki-Artikel zur Bonferroni-Korrektur ganz gut, wie mein Design aussieht. Ich habe meine verschiedenen Gruppen, die entweder nicht behandelt wurden oder einer Behandlung über mehrere Tage ausgesetzt waren. An drei verschiedenen Zeitpunkten habe ich Proben genommen und im Anschluss die Genexpression gemessen.

[strukturmarionette]

Hi,

- warum zwei unbehandelte UV-Gruppen?

Gruß
S.
(P.S. WIKI sind nicht wissenschaftlich)

[kablau90]

Hallo,

es gibt zwei Kontroll-Gruppen, weil eines der Pestizide ein zusätzliches Lösungsmittel benötigte und dieses ebenfalls geteste wurde. Dass Wiki keine wissenschaftliche Quelle ist, versteht sich von selbst. Was dort steht, wird aber hoffentlich nicht komplett an den Haaren herbeigezogen sein oder ist das dort genannte Beispiel falsch?